O Guaraná, apesar de ser muito bom para tratar bastantes problemas e ajudar em outros, mas não há bela sem senão e o tem efeitos secundários que devem ser precavidos. O Pó de Guaraná é bastante rico em substâncias como a teobromina, a teofilina ou a guaranina, que têm efeitos similares ao da cafeína, pode causar dependência física e psicológica.
Essas substâncias actuam também, por mecanismos similares às anfetaminas e à cocaína, agindo nos mesmos receptores do sistema nervoso central. Com efeitos, no entanto, não tão graves do que essas drogas. Usado a longo prazo, pode a causar insónia.
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